恩底弥翁的奇迹

三年前，太空飞船猎户号坠毁在学园都市，这一事件引发了严重的惨剧，但也促成了宇宙电梯“恩底弥翁”的建设。

在恩底弥翁接近完工的前夕，上条当麻和茵蒂克丝遇到了拥有“奇迹”的歌声的少女鸣护艾丽莎。

艾丽莎心怀梦想，经过不断的修业和努力，终于得到了试镜的机会，并有可能在恩底弥翁落成的庆祝活动中演唱。

然而，在这一晚，当麻、茵蒂克丝和艾丽莎在夜归途中遭到了史提尔率领的魔法师们的攻击。

学园都市秩序维持部队的介入，标志着魔法侧和科学侧全面战争即将爆发。艾丽莎的体内究竟隐藏着怎样的力量和秘密，故事也由此展开。