某科学的一方通行

故事以学园都市最强的超能力者——一方通行为主角。

一方通行因在8月31日头部中弹而入院治疗，枪击导致他的前头叶受损，失去了演算能力和语言能力。

在冥土追魂的治疗下，他借助御坂网络进行代理演算，从而恢复了一部分能力。然而，在住院期间，他意外地卷入了学园都市的黑暗斗争中。

原本以为能在住院期间享受平静时光的一方通行，因为某位少女的意外到访而再次陷入混沌。

这位少女是死灵术师埃斯特·罗森塔尔，她为了某个目的而调查最后之作。在埃斯特的协助下，一方通行开始与学园都市内的各种势力战斗，包括DA（Dog AssDisciplinary Action）组织、统括理事会等。

在战斗中，一方通行不仅展现了其压倒性的实力，还逐渐揭示了学园都市背后的黑暗秘密。

他与埃斯特、最后之作等人共同面对敌人，展开了一场场惊心动魄的冒险。